273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6284 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6284  PAS domain-containing protein  100 
 
 
223 aa  443  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1503  PAS domain-containing protein  38.15 
 
 
186 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1215 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3578  hypothetical protein  33.15 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1795  PAS fold-3 domain protein  36.94 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.591789  normal  0.0452866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
603 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
793 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
767 aa  71.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  35.81 
 
 
1225 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1225 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
883 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1982  PAS fold-3 domain protein  31.33 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282752  normal  0.0152652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0132  PAS domain-containing protein  31.87 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.272922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
810 aa  69.7  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
759 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
1532 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
943 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
689 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1761  PAS domain-containing protein  28.32 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 
922 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
494 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4253  PAS domain-containing protein  29.8 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.486718  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  31.3 
 
 
691 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
845 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
582 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5109  PAS fold-3 domain protein  29.83 
 
 
197 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.924849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1198  PAS fold-3 domain protein  27.87 
 
 
187 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
896 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
2693 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
1654 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
938 aa  59.3  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 
998 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
806 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5882  PAS domain-containing protein  27.89 
 
 
202 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.683919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 
1224 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 
956 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
1501 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
551 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
511 aa  58.2  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  29.2 
 
 
691 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3556  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.99 
 
 
905 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88325  normal  0.39495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
686 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
823 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4390  PAS domain-containing protein  25.13 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000850983  normal  0.838012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
674 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
944 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
675 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
812 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
745 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 
1808 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3696  hypothetical protein  29.35 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.87171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
986 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  29.46 
 
 
685 aa  55.5  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
513 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  26.39 
 
 
847 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3387  hypothetical protein  29.35 
 
 
209 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.483515 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 
1167 aa  55.1  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
526 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
512 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
1274 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
721 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
674 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0529  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.66 
 
 
575 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
1068 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1086 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
626 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
492 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
1560 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
568 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
1171 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
830 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
682 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3718  PAS domain-containing protein  27.32 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.243172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
1714 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
814 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
3706 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 
1344 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
887 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 
685 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
688 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
865 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
547 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
789 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  29.71 
 
 
512 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
1669 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
1676 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
951 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 
1069 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  25.26 
 
 
463 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1222  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.95 
 
 
815 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0390  ligand-binding sensor domain-containing protein  26.11 
 
 
1275 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
515 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
1116 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5027  hypothetical protein  27.04 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.565398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2325  PAS domain-containing protein  29.92 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2826  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.34 
 
 
1260 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616256  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
695 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
977 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
888 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
384 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>