245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4621 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 298 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  49.14 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  45.3 
 
 		 282 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  44.41 
 
 		 282 aa  261  8.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  49.06 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  45.35 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  44.09 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  44.09 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  44.09 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  44.09 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  44.09 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  43.14 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  43.92 
 
 		 278 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  42.52 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  41.2 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  41.94 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  41.96 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  41.33 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  42.52 
 
 		 276 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  37.87 
 
 		 279 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  36.22 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  33.68 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  37.79 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  38.93 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  42.52 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  38.82 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  39.35 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  41.34 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  38.46 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 277 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  36.86 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  36.86 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 570 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  30.59 
 
 		 264 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  29.18 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.48 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 606 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  32.14 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  33.57 
 
 		 604 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.8 
 
 		 237 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.48 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  30.12 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.57 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.97 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 633 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  26.11 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  27.71 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.74 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  27.78 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  28.29 
 
 		 276 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  28.79 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 268 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  28.85 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.14 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  30.56 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  25.34 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>