149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4135 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  100 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  75.32 
 
 
312 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  75.96 
 
 
312 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  53.12 
 
 
304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  47.33 
 
 
310 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  47.33 
 
 
310 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  46.67 
 
 
310 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  47.37 
 
 
310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  49.67 
 
 
308 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  51.06 
 
 
315 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  48.87 
 
 
282 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  48.61 
 
 
290 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  47.37 
 
 
297 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  46.15 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  45.32 
 
 
286 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  43.51 
 
 
321 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  47.1 
 
 
320 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  43.94 
 
 
296 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  40.43 
 
 
289 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  47.55 
 
 
293 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  46.44 
 
 
274 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  47.55 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  47.55 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  40.52 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  40.07 
 
 
275 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  40.07 
 
 
289 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  39.71 
 
 
289 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.71 
 
 
300 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  41.01 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  39.34 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  42.28 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  42.55 
 
 
273 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  37.59 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  40.94 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  39.42 
 
 
287 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  40.44 
 
 
289 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
307 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  40.44 
 
 
291 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  41.61 
 
 
294 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  37.87 
 
 
289 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  36.62 
 
 
283 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  37.15 
 
 
320 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  39.47 
 
 
271 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  39.1 
 
 
271 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  38.77 
 
 
287 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  38.06 
 
 
302 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  38.33 
 
 
290 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  39.86 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  36.23 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  35.56 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  37.24 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  37.97 
 
 
325 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  38.28 
 
 
305 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
327 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  37.63 
 
 
290 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  49.38 
 
 
198 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  49.38 
 
 
198 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  36.21 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  35.53 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  35.86 
 
 
313 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
302 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  33.99 
 
 
323 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
314 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  35.52 
 
 
304 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  36.21 
 
 
304 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  35.17 
 
 
304 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.14 
 
 
296 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  34.95 
 
 
312 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  35.17 
 
 
302 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  37.18 
 
 
302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  37.18 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  34.36 
 
 
296 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  34.8 
 
 
287 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
301 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  34.93 
 
 
296 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33.22 
 
 
295 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
296 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
295 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  37.13 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  35.16 
 
 
290 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
295 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  31.73 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
285 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
318 aa  122  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  32.8 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  32.8 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  33.11 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  33.98 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  31.09 
 
 
275 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.73 
 
 
330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  32.73 
 
 
330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  32.73 
 
 
330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  32.73 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  32.73 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  32.73 
 
 
330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  32.73 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
277 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>