More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2499 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  276  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  51.46 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  43.09 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  45.24 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  47.57 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  41.46 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  42.86 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  40 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  43.56 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 182 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  42.48 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  38.46 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.05 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  42 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  31.3 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  36.61 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  41 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  47.06 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  35.71 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2645  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  35 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  39.13 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2105  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  38.83 
 
 		 194 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2711  response regulator  37.17 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2444  response regulator receiver  37.17 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.986911  decreased coverage  0.00021442 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 741 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 807 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.15 
 
 		 695 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1651 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 695 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  34.31 
 
 		 571 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3762  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3896  hypothetical protein  33.06 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 732 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 966 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 789 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 789 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2141  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217748  hitchhiker  0.000119554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  35.25 
 
 		 280 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4367  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.711428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 573 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 589 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2001  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1646 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1631 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  36.36 
 
 		 692 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1036 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 589 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  33.06 
 
 		 685 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 899 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  34.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>