More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2404 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 308 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  71.57 
 
 		 315 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.46 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.99 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  65.38 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  60.34 
 
 		 316 aa  340  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  54.9 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  63.93 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  53.16 
 
 		 315 aa  305  6e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  54.55 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  54.55 
 
 		 288 aa  301  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  52.58 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  50.17 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  48.99 
 
 		 334 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  46.31 
 
 		 302 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  48.6 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  47.9 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  48.57 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  47.9 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  47.55 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  48.6 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  51.05 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  55.36 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  47.4 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  47.4 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  43.64 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  53.85 
 
 		 294 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  47.75 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  50.39 
 
 		 294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  48.99 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.3 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  45.55 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  46.79 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  49.07 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  50 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  50.19 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  45.55 
 
 		 286 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  48.74 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  47.06 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  48.7 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  46.5 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  53.41 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  48.74 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  48.74 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  50.17 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  43.99 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 286 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  45.85 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  48.38 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  43.1 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  48.64 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  47.22 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  49.28 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  46.32 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  45.96 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  45.96 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  48.28 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  43.34 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  48.26 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  46.21 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  46.92 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  41.01 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  46.6 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  46.48 
 
 		 292 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  47.7 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  46.72 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  44.04 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.23 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  46.02 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  44.88 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.91 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  46.02 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  46.15 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  47.3 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  46.92 
 
 		 291 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  45.72 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  47.52 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  47.52 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  47.52 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  47.52 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  47.52 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  47.52 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  41.01 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  41.01 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  50.76 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  46.23 
 
 		 291 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  50.38 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  44.8 
 
 		 286 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  46.67 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  48.21 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  48.21 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  44.76 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48350  hypothetical protein  45.26 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707172  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  46.32 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.93 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  39.69 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  38.89 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.93 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>