More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1475 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  249  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  62.71 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  59.68 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  61.95 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  58.87 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  56.64 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  57.41 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  55.56 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  56.48 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  57.94 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  56.14 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  52.85 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  52.85 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  52.88 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  47.75 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  48.8 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  46.9 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  47.32 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  44.44 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 128 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  47.11 
 
 		 128 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  46.79 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  55.68 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  49 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  41.07 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  44 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.12 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  40.87 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  42.62 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  48.04 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  39.09 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 127 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38.39 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 696 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  51.72 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 688 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 1036 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 173 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  39.52 
 
 		 1036 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  34.86 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  41.18 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  36.7 
 
 		 695 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  37.96 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 695 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  36.21 
 
 		 507 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  50.75 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 548 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  32.76 
 
 		 580 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  38.46 
 
 		 845 aa  70.9  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  39 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  38.98 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  35.4 
 
 		 573 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 705 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>