292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1116 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1116  inner-membrane translocator  100 
 
 		 382 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1702  inner-membrane translocator  91.69 
 
 		 385 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.122598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2021  inner-membrane translocator  91.17 
 
 		 385 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  66.85 
 
 		 375 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  64.91 
 
 		 375 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  67.99 
 
 		 392 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  59.52 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1168  inner-membrane translocator  56.63 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5242  inner-membrane translocator  61.67 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1369  ABC transporter, inner membrane subunit  60.52 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0719579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1359  ABC transporter, permease protein  55.81 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  55.66 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0852  inner-membrane translocator  50 
 
 		 362 aa  298  8e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0768  ABC transporter permease protein  54.85 
 
 		 365 aa  279  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3025  inner-membrane translocator  56.31 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0837  inner-membrane translocator  53.17 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 347 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.02 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.24 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.93 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 361 aa  139  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  34.68 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  26.74 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  34.21 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  31.82 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 361 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  29.65 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.33 
 
 		 471 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  25.6 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 349 aa  123  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  31.98 
 
 		 363 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.65 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  33 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 367 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  26.27 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  24.44 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  27.97 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 400 aa  116  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  30 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 364 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  32.15 
 
 		 365 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 361 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  28.57 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  28.57 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>