More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2043 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  100 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  54.76 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  55.2 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  54.17 
 
 		 195 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  57.41 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  50.4 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  48.39 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  48.39 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  49.6 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  49.6 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  52.38 
 
 		 135 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  48.12 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  47.41 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  51.43 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  51.89 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  53.4 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  53.4 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  53.4 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  53.4 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  53.4 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  53.4 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  53.4 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  46.36 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  47.83 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  47.83 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  47.83 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  47.83 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  47.83 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  53.1 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  47.83 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  51.24 
 
 		 137 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  53.27 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  53.27 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  52.34 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  51.4 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  43.93 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  42.37 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  35.14 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  36.36 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  39.64 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  37 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  34.17 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 158 aa  67  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.38 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40.95 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  33 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  38.46 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.19 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 		 195 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  34.91 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  31.73 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  35.9 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  26.5 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>