More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1287 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 900 aa  651    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 		 915 aa  1329    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  70.91 
 
 		 914 aa  1377    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 892 aa  740    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 925 aa  829    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 892 aa  737    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 899 aa  663    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 913 aa  1202    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 923 aa  1003    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 896 aa  667    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 913 aa  1886    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 910 aa  749    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 926 aa  871    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 916 aa  1261    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 892 aa  729    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 923 aa  1004    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 892 aa  737    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 926 aa  844    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 913 aa  969    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 882 aa  746    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 892 aa  646    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 924 aa  810    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 907 aa  654    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 892 aa  637    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 926 aa  833    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 892 aa  629  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 904 aa  608  9.999999999999999e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 889 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 876 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 856 aa  274  6e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 870 aa  273  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 		 889 aa  267  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 878 aa  267  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 881 aa  264  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 875 aa  264  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 879 aa  264  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 879 aa  263  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 877 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 886 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 886 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 879 aa  258  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 886 aa  257  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 876 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 874 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 880 aa  254  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 867 aa  253  9.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 879 aa  253  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 875 aa  253  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 878 aa  253  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 865 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 892 aa  253  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 869 aa  251  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 876 aa  251  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 876 aa  250  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 876 aa  250  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 872 aa  249  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  249  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 878 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  248  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 874 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 877 aa  248  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 876 aa  248  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 876 aa  248  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 880 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 874 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 		 865 aa  248  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 876 aa  247  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 874 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  25.78 
 
 		 876 aa  247  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 878 aa  246  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 865 aa  245  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3034  alanyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 888 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672449  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 865 aa  245  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  24.95 
 
 		 879 aa  245  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 		 897 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 886 aa  245  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 892 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 880 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 897 aa  244  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 880 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 880 aa  244  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 880 aa  244  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 874 aa  244  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 884 aa  244  7e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 875 aa  244  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 863 aa  243  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 890 aa  243  9e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 863 aa  243  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 		 874 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 897 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 874 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 872 aa  243  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 880 aa  243  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 880 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  25.72 
 
 		 880 aa  242  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 876 aa  243  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 		 880 aa  243  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 880 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  25.72 
 
 		 876 aa  243  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 880 aa  243  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>