66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6631 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 283 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  36.58 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  34.9 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  30.41 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2739  hypothetical protein  98.08 
 
 		 56 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  34.29 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  35.07 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  40.94 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  33.81 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  33.81 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  30.07 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  38.99 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  34.9 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  43.75 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  34.23 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  34.23 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  34.23 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  34.23 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  34.23 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.71 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  33.56 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  33.56 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  30.3 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  33.56 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  33.99 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  29.97 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  29.97 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  34.44 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  34.13 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  28.19 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  35.67 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  28.98 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  29.19 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  27.97 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  28.07 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  27.76 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  28.69 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.29 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  27.36 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  28.29 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  32.63 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  33.93 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  34.19 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  30.57 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  30.12 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  29.49 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  29.69 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.24 
 
 		 565 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  30.77 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  41.35 
 
 		 564 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  33.91 
 
 		 400 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  33.33 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  32.74 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  23.72 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  36.64 
 
 		 307 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  31.2 
 
 		 692 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  32.77 
 
 		 653 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  18.87 
 
 		 927 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  30.58 
 
 		 621 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  23.53 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  23.53 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  31.5 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 588 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  30.09 
 
 		 722 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  29.96 
 
 		 317 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  27.48 
 
 		 343 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>