More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3535 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  41.55 
 
 		 1353 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  43.34 
 
 		 1190 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  42.78 
 
 		 1263 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 1160 aa  2300    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  40.6 
 
 		 1192 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  42.52 
 
 		 1203 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  36.61 
 
 		 1164 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  43.88 
 
 		 1248 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  34.12 
 
 		 1285 aa  390  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1096 aa  170  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  33.85 
 
 		 1115 aa  157  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1032 aa  146  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1032 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1127 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1268 aa  112  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  45.22 
 
 		 260 aa  108  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  43.48 
 
 		 260 aa  105  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  41.83 
 
 		 915 aa  105  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  44.83 
 
 		 196 aa  104  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  45.61 
 
 		 282 aa  101  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  37.14 
 
 		 457 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  42.24 
 
 		 198 aa  96.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  36.6 
 
 		 669 aa  96.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 		 247 aa  95.9  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.35 
 
 		 233 aa  95.5  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 		 291 aa  94.7  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  36 
 
 		 174 aa  94.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  41.74 
 
 		 258 aa  94.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  35.16 
 
 		 273 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 		 251 aa  94  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 245 aa  93.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  36.05 
 
 		 921 aa  94  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  46.28 
 
 		 139 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 303 aa  92.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  52 
 
 		 202 aa  92.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  35.94 
 
 		 305 aa  91.7  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  27.5 
 
 		 247 aa  91.3  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 		 321 aa  91.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 239 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 206 aa  90.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  34.27 
 
 		 362 aa  90.1  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 		 203 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  42.73 
 
 		 201 aa  89.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  42.15 
 
 		 208 aa  89  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 318 aa  89  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  45.56 
 
 		 211 aa  88.6  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 243 aa  88.2  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  41.41 
 
 		 191 aa  87.8  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 280 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  39.67 
 
 		 217 aa  87.4  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  34.92 
 
 		 281 aa  87  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  39.02 
 
 		 197 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 196 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  35.75 
 
 		 362 aa  87  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 235 aa  87  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 		 204 aa  87.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 		 218 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  36.46 
 
 		 701 aa  85.9  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 278 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  38.21 
 
 		 197 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 		 239 aa  85.5  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  38.21 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 207 aa  85.1  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  37.31 
 
 		 209 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 217 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  39.13 
 
 		 241 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  47.83 
 
 		 189 aa  84.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 291 aa  84.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 		 234 aa  84.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 251 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.29 
 
 		 239 aa  84  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  36.07 
 
 		 208 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  36.22 
 
 		 244 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  37.86 
 
 		 189 aa  84  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  38.4 
 
 		 242 aa  84  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  50 
 
 		 914 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 		 340 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 251 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 251 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 212 aa  82.4  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 228 aa  82.4  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  42.28 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.83 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  42.59 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  39.66 
 
 		 204 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 		 341 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  38.4 
 
 		 251 aa  80.9  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  39.66 
 
 		 204 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  35.8 
 
 		 794 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  40.4 
 
 		 216 aa  80.1  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 		 209 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>