More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0245 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  88.14 
 
 		 388 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  100 
 
 		 388 aa  784    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  71.91 
 
 		 388 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  71.65 
 
 		 388 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  70.03 
 
 		 390 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  71.13 
 
 		 390 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  65.04 
 
 		 390 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  62.27 
 
 		 388 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  62.63 
 
 		 389 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  63.87 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  64.36 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  64.19 
 
 		 390 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  61.14 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  61.14 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  64.27 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  63.14 
 
 		 387 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  61.6 
 
 		 387 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  63.04 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  61.95 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  62.82 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  61.54 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  61.86 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  62.4 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  61.76 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  63.43 
 
 		 390 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  61.34 
 
 		 387 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  59.74 
 
 		 387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  61.34 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  59.74 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  61.08 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  63.66 
 
 		 389 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  58.1 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  55.3 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  57.51 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  55.3 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  55.81 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  52.84 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  53.61 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  54.52 
 
 		 386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  53.37 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  54.43 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  54.26 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  55.81 
 
 		 389 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  50.5 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  50.88 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  54.4 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  54.4 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  54.17 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  55.21 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  53.35 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  50.88 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  54.15 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  52.47 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  55.47 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.87 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  51.03 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.87 
 
 		 396 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  55.21 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.61 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.24 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  51.13 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  51.13 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  47.67 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  51.13 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  50.88 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.19 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  54.21 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  54.95 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  50.26 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  50.63 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  48.27 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.97 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  49.74 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  51.72 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  49.87 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  51.07 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.86 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  49.1 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.45 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  49.87 
 
 		 389 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  51.56 
 
 		 389 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  50.8 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  50.26 
 
 		 399 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.86 
 
 		 398 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  52.14 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  47.86 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.12 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  50.78 
 
 		 388 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  51.41 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.84 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50.92 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  50.9 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 412 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50.9 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50.9 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  44.86 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.36 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.36 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.36 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  50.13 
 
 		 405 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>