293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3044 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  100 
 
 		 464 aa  925    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  44.01 
 
 		 436 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 444 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  42.48 
 
 		 440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 453 aa  332  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 		 456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  47.38 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 420 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 421 aa  249  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  37.47 
 
 		 394 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  39.57 
 
 		 307 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  28 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  28 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  23.02 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  27.01 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.31 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.49 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  24.16 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.16 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  25.3 
 
 		 686 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  24.74 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.44 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.26 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  41.86 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  24.74 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.11 
 
 		 1806 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  23.91 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  23.91 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25.45 
 
 		 688 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.32 
 
 		 2720 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  34.71 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  34.71 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.18 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  34.71 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  34.71 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  33.33 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  34.71 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  34.71 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  34.71 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  25.4 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  24.5 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  23.63 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  39.08 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.86 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  25.08 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.67 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.78 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  26.48 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  28.57 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.71 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>