More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0172 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  100 
 
 		 570 aa  1153    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  56.33 
 
 		 573 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  55.85 
 
 		 571 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  57.71 
 
 		 569 aa  626  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  56.68 
 
 		 569 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  56.86 
 
 		 569 aa  621  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  55.81 
 
 		 570 aa  618  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  55.4 
 
 		 567 aa  616  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  55.3 
 
 		 566 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  55.11 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  55.28 
 
 		 570 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  54.93 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  54.38 
 
 		 569 aa  608  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  54.94 
 
 		 575 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  53.78 
 
 		 565 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  54.68 
 
 		 565 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  54.14 
 
 		 565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  53.96 
 
 		 565 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  55.75 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  55.93 
 
 		 566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  53.64 
 
 		 577 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  53.32 
 
 		 571 aa  599  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  53.06 
 
 		 561 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  53.14 
 
 		 561 aa  598  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  53.49 
 
 		 571 aa  598  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  53.14 
 
 		 561 aa  598  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  54.76 
 
 		 566 aa  591  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  54.76 
 
 		 566 aa  591  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  54.29 
 
 		 569 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  55.08 
 
 		 566 aa  591  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  51.98 
 
 		 560 aa  589  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  54.4 
 
 		 566 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  55.2 
 
 		 568 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  52.26 
 
 		 558 aa  585  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  55.06 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  52.25 
 
 		 561 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  52.69 
 
 		 566 aa  587  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  52.36 
 
 		 582 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  52.89 
 
 		 558 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1495  30S ribosomal protein S1  54.72 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  55.6 
 
 		 567 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  52.26 
 
 		 558 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  53.15 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  55.08 
 
 		 567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  51.89 
 
 		 558 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  54.66 
 
 		 569 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  51.89 
 
 		 558 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  51.71 
 
 		 558 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  50.99 
 
 		 561 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  51.89 
 
 		 558 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2339  30S ribosomal protein S1  52.88 
 
 		 569 aa  579  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00489204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  53.16 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  53.16 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  50.09 
 
 		 569 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  50.09 
 
 		 569 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  52.78 
 
 		 559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  51.34 
 
 		 560 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  53.16 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  53.16 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  52.61 
 
 		 556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  53.16 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2237  30S ribosomal protein S1  52.7 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000585516  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  49.64 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  51.63 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1735  30S ribosomal protein S1  52.34 
 
 		 557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  50.99 
 
 		 559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 560 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  52.54 
 
 		 555 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  52.88 
 
 		 559 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  52.98 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  50.99 
 
 		 559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  51.63 
 
 		 555 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  51.63 
 
 		 556 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  51.27 
 
 		 555 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2003  30S ribosomal protein S1  51.98 
 
 		 565 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0183924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  51.27 
 
 		 555 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  51.07 
 
 		 561 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  51.27 
 
 		 555 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  50.18 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  51.45 
 
 		 555 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  52.25 
 
 		 558 aa  569  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  50.81 
 
 		 560 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1955  30S ribosomal protein S1  52.34 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132161  normal  0.358522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  52.45 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  51.63 
 
 		 555 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  51.63 
 
 		 555 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  52.17 
 
 		 555 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  51.63 
 
 		 555 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  51.27 
 
 		 555 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2668  30S ribosomal protein S1  52.34 
 
 		 557 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  51.63 
 
 		 555 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>