118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1479 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 717 aa  1379    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0441  surface protein  76.31 
 
 		 681 aa  630  1e-179  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0510  surface protein, anchor region  52.77 
 
 		 655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0396  triple helix repeat-containing collagen  94.53 
 
 		 684 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0162411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  37.29 
 
 		 300 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  36.13 
 
 		 606 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  54.64 
 
 		 380 aa  91.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  37.96 
 
 		 815 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  38.4 
 
 		 1055 aa  89  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  57.29 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  37.29 
 
 		 1219 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  39.46 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  37.97 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  42.54 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  48.28 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  34.02 
 
 		 688 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  55.95 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  48.91 
 
 		 621 aa  80.9  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 		 426 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  53.76 
 
 		 252 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  55.95 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  41.74 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  47.47 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  63.24 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  54.74 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  46.81 
 
 		 645 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  51.52 
 
 		 390 aa  77  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  45.71 
 
 		 298 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  48.45 
 
 		 936 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  47.83 
 
 		 438 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  41.74 
 
 		 437 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  45.65 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  45.65 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  54.88 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  54.88 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  63.38 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  45.65 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  48.39 
 
 		 706 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  29.91 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  47.19 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  43.7 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  44.68 
 
 		 1198 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  30.36 
 
 		 322 aa  72.8  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  48.39 
 
 		 748 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  43.62 
 
 		 222 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  45.74 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  60 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  33.92 
 
 		 1451 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  37.36 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  44.33 
 
 		 813 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  35.43 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  49.45 
 
 		 835 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  41.49 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  34.53 
 
 		 1168 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  42.5 
 
 		 366 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  47.83 
 
 		 230 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1147 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  34.92 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  54.32 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  45.16 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  46.81 
 
 		 835 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  45.13 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.39 
 
 		 867 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  55.56 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  45.35 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  47.01 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  40.4 
 
 		 2851 aa  63.5  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  34.85 
 
 		 366 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  63.16 
 
 		 314 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  56.67 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  38.3 
 
 		 288 aa  62  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  35.29 
 
 		 1426 aa  61.6  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  47.5 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  39.78 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  43.3 
 
 		 466 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  39.47 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  47.19 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4887  collagen triple helix repeat protein  46.84 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1259  hypothetical protein  44.64 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.459414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  40.43 
 
 		 2914 aa  57.4  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  32.47 
 
 		 1321 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  25.9 
 
 		 303 aa  57  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2281  hypothetical protein  42.16 
 
 		 348 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  39.13 
 
 		 1101 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  32.37 
 
 		 835 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  31.75 
 
 		 934 aa  55.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  50.85 
 
 		 428 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  36.27 
 
 		 316 aa  55.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  45.45 
 
 		 307 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  43.82 
 
 		 582 aa  54.3  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  38.89 
 
 		 704 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  44.95 
 
 		 1170 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  35.29 
 
 		 542 aa  53.9  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  41.24 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1117  triple helix repeat-containing collagen  66.67 
 
 		 292 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  43.24 
 
 		 1297 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  40.52 
 
 		 1148 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  47.83 
 
 		 360 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  44.32 
 
 		 838 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>