81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0441 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0441  surface protein  100 
 
 
681 aa  1305    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  74.55 
 
 
717 aa  907    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0510  surface protein, anchor region  51.01 
 
 
655 aa  568  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0396  triple helix repeat-containing collagen  87.5 
 
 
684 aa  230  5e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0162411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  35.16 
 
 
1055 aa  65.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  73.08 
 
 
314 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  75 
 
 
295 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  52.38 
 
 
230 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  49.32 
 
 
621 aa  63.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  44.03 
 
 
380 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  38.17 
 
 
815 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  37.37 
 
 
300 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  37.5 
 
 
459 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  63.16 
 
 
445 aa  61.6  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  35.9 
 
 
606 aa  61.6  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  64.81 
 
 
469 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  35.38 
 
 
1219 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  68.52 
 
 
369 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4887  collagen triple helix repeat protein  63.16 
 
 
305 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  64.81 
 
 
647 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  67.92 
 
 
524 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  68.52 
 
 
300 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  58.82 
 
 
428 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  66.67 
 
 
426 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  62.96 
 
 
360 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  64.81 
 
 
390 aa  55.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  60.78 
 
 
435 aa  55.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  67.44 
 
 
437 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  53.03 
 
 
523 aa  54.7  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  34.22 
 
 
936 aa  54.7  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  38.89 
 
 
462 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  62.96 
 
 
274 aa  53.9  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  28.19 
 
 
319 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  44.16 
 
 
434 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  34.95 
 
 
252 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  66.67 
 
 
639 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  42.17 
 
 
451 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  50.85 
 
 
1198 aa  52.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  42.17 
 
 
437 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  42.17 
 
 
437 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  42.17 
 
 
437 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  50.85 
 
 
438 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  42.17 
 
 
439 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  58.46 
 
 
326 aa  51.2  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  31.07 
 
 
1101 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  66.04 
 
 
348 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  51.72 
 
 
644 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  50 
 
 
645 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  32.34 
 
 
748 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  53.7 
 
 
706 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  40.98 
 
 
767 aa  47.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  33.96 
 
 
688 aa  47.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  51.85 
 
 
582 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  49.09 
 
 
298 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  32.86 
 
 
1147 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1259  hypothetical protein  41.58 
 
 
403 aa  47  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.459414  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  47.17 
 
 
158 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  31.13 
 
 
842 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3048  hypothetical protein  39.33 
 
 
175 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.987312  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  32.55 
 
 
1168 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  51.92 
 
 
253 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  45.28 
 
 
730 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  43.4 
 
 
308 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  37.04 
 
 
283 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  47.22 
 
 
835 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  33.69 
 
 
1451 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  49.09 
 
 
468 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  47.56 
 
 
473 aa  45.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  27.89 
 
 
322 aa  45.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  65.85 
 
 
299 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  42.67 
 
 
478 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  39.08 
 
 
466 aa  44.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  45.28 
 
 
221 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  42.67 
 
 
481 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  61.7 
 
 
347 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  61.7 
 
 
347 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  34.62 
 
 
709 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  49.33 
 
 
867 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  43.4 
 
 
222 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  49.18 
 
 
835 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  75 
 
 
1148 aa  43.9  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>