89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0396 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  84.17 
 
 		 717 aa  1040    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0396  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 684 aa  1327    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0162411  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0510  surface protein, anchor region  49.79 
 
 		 655 aa  569  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0441  surface protein  87.5 
 
 		 681 aa  230  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  38.16 
 
 		 1055 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  38.95 
 
 		 815 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  50.63 
 
 		 621 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  73.68 
 
 		 314 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  47.5 
 
 		 230 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  37.89 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  34.01 
 
 		 606 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  63.49 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  65.57 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  68.33 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  63.16 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  36.63 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  65 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  38.54 
 
 		 1219 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  63.16 
 
 		 435 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  72.92 
 
 		 295 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  60 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  33.73 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  65 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  68.33 
 
 		 300 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  34.39 
 
 		 936 aa  61.6  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  59.65 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  63.93 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4887  collagen triple helix repeat protein  47.25 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  37.95 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  66.1 
 
 		 390 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  72.92 
 
 		 283 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  54.55 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  66.1 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  43.37 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  44.71 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  29.41 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  45.12 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  43.37 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  43.37 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  43.37 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  43.37 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  33.16 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  42.11 
 
 		 706 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  50 
 
 		 1198 aa  54.7  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  64.41 
 
 		 348 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1259  hypothetical protein  43.93 
 
 		 403 aa  54.3  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.459414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  41.3 
 
 		 645 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  51.67 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  29.11 
 
 		 322 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  67.39 
 
 		 347 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  66.04 
 
 		 639 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  50.77 
 
 		 644 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  33.9 
 
 		 688 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  67.39 
 
 		 347 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 298 aa  50.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  40.98 
 
 		 308 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  33.16 
 
 		 813 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  77.08 
 
 		 1148 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  44.26 
 
 		 730 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  36.76 
 
 		 283 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  65.96 
 
 		 274 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  34.38 
 
 		 1168 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  52.38 
 
 		 473 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  33.5 
 
 		 835 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 468 aa  48.5  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  55 
 
 		 1451 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  35.92 
 
 		 481 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  45.61 
 
 		 158 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  43.1 
 
 		 222 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  35.92 
 
 		 478 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2281  hypothetical protein  44.83 
 
 		 348 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.78 
 
 		 867 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 253 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  40.43 
 
 		 835 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  47.89 
 
 		 835 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  43.68 
 
 		 366 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1147 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1117  triple helix repeat-containing collagen  72.73 
 
 		 292 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  33.33 
 
 		 709 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  48.33 
 
 		 466 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2077  triple helix repeat-containing collagen  58.14 
 
 		 130 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  44.07 
 
 		 442 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  45 
 
 		 366 aa  45.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  45.45 
 
 		 558 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  40.98 
 
 		 382 aa  45.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  45.28 
 
 		 221 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  42.37 
 
 		 288 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  41.43 
 
 		 542 aa  43.9  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  42.37 
 
 		 1426 aa  43.9  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>