More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1183 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1183  phage integrase family protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1451  phage integrase family protein  95.6 
 
 		 182 aa  357  4e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0649583 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0457  integrase family protein  95.6 
 
 		 182 aa  356  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  89.01 
 
 		 182 aa  327  7e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  31.52 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.73 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  31.37 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 309 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  24.86 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  30.52 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  29.38 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  30.97 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  26.23 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 		 302 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 295 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  24.72 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.25 
 
 		 302 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  30.41 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.25 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  26.23 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  28.49 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  28.09 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.27 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  27.61 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  28.09 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  25.97 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.06 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  28.09 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.06 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  30.05 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  27.7 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 322 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.81 
 
 		 297 aa  64.7  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  26.38 
 
 		 309 aa  64.7  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  27.38 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 322 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 298 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.86 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.33 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  25.42 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  26.7 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.45 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  25.44 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.31 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  26.19 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  24.72 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 296 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  27.03 
 
 		 300 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  27.03 
 
 		 300 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  28.66 
 
 		 307 aa  62  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  31.43 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 329 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 296 aa  62  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 333 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>