More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0504 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  100 
 
 
368 aa  729    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  54.69 
 
 
374 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  52.15 
 
 
376 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  51.87 
 
 
381 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  48.53 
 
 
379 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  55.41 
 
 
378 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  50 
 
 
384 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  50.79 
 
 
388 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  49.47 
 
 
384 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 
387 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  50.27 
 
 
384 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 
384 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  51.6 
 
 
382 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  53.8 
 
 
390 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  52.53 
 
 
390 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  47.72 
 
 
378 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  49.47 
 
 
378 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  51.9 
 
 
378 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  54.62 
 
 
390 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  48.53 
 
 
380 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  53.8 
 
 
390 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  49.47 
 
 
378 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  52.46 
 
 
385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  49.2 
 
 
382 aa  359  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  53.23 
 
 
371 aa  358  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  52.19 
 
 
385 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  49.87 
 
 
377 aa  354  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  50.13 
 
 
377 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 
378 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  43.72 
 
 
691 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  41.58 
 
 
369 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  43.8 
 
 
373 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  42.39 
 
 
369 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  43.65 
 
 
373 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  43.01 
 
 
373 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  43.01 
 
 
373 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  43.01 
 
 
373 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  43.39 
 
 
373 aa  279  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  43.39 
 
 
373 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 
373 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  43.68 
 
 
375 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  43.12 
 
 
373 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  43.43 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  43.16 
 
 
367 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  42.25 
 
 
371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  41.87 
 
 
369 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.39 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  42.9 
 
 
366 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  40.1 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  42.2 
 
 
366 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  42.82 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  43.04 
 
 
370 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  38.9 
 
 
382 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  33.87 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  38.79 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  36.68 
 
 
379 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 
376 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
376 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 
366 aa  219  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  37.33 
 
 
376 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  36.53 
 
 
376 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  37.03 
 
 
370 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.96 
 
 
376 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  34.95 
 
 
373 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  36.53 
 
 
377 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
377 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 
373 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 
376 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  33.33 
 
 
375 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  33.77 
 
 
377 aa  203  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  35.42 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  33.07 
 
 
376 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
378 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 
376 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 
368 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
369 aa  192  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 
368 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  34.55 
 
 
377 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 
364 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 
376 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  34.93 
 
 
381 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  31.56 
 
 
378 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
380 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  31.35 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  33.42 
 
 
371 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 
379 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 
372 aa  182  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 
380 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 
380 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  31.45 
 
 
375 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  31.38 
 
 
377 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 
377 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.38 
 
 
378 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
377 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>