204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0535 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  332  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  43.71 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  43.42 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  34.29 
 
 		 321 aa  95.5  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  36.75 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  34.29 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  37.17 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  38.73 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  38.66 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  36.67 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  37.82 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  39.05 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  39.42 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  37.74 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  32.09 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  34.4 
 
 		 245 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  36.8 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  37.29 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  38.83 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  36.79 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  35.51 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  35.04 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  37.39 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  36.89 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  35 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  38.61 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  39.09 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  35 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  36.11 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  37.82 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  34.38 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  33.6 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  34.11 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  31.3 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  36.84 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  36.88 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  33.05 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  33.05 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  38.6 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  34.68 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  36.81 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  34.68 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  33.79 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  41.75 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  34.15 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  36.88 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  33.6 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  33.6 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  34.68 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  34.4 
 
 		 246 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  36.11 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  33.6 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  34.68 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  34.68 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  34.68 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  34.68 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  34.17 
 
 		 244 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  33.05 
 
 		 244 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 244 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  34.68 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  38.1 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  32.8 
 
 		 241 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  35.34 
 
 		 256 aa  67  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  34.93 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  32.37 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  34.48 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  34.19 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  34.21 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  33.07 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  39.42 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  35.04 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  33.88 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  37.14 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  35 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  36.28 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  34.96 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.6 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  35.71 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  37.62 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.04 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  40.2 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  34.56 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  32.74 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  33.08 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  38.61 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  39 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  33.9 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>