More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0275 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
263 aa  542  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  59.92 
 
 
263 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  56.2 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  58.14 
 
 
260 aa  308  8e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  56.37 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  52.11 
 
 
267 aa  251  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  47.67 
 
 
261 aa  242  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  47.79 
 
 
265 aa  231  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 
264 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  45.02 
 
 
264 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 
264 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  43.85 
 
 
264 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 
252 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  39.11 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  39.45 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 
248 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 
250 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
265 aa  169  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  40.99 
 
 
242 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
265 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  39.54 
 
 
255 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  38.64 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.92 
 
 
252 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 
247 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
264 aa  158  7e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
253 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  41.09 
 
 
253 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  41.35 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  36.93 
 
 
260 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
255 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
260 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.45 
 
 
264 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
252 aa  151  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  36.74 
 
 
257 aa  151  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  36.26 
 
 
258 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  36.12 
 
 
259 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  37.12 
 
 
272 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  40.23 
 
 
293 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  37.79 
 
 
258 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  35.23 
 
 
287 aa  148  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
258 aa  148  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  37.89 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  39.15 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  39.53 
 
 
270 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 
253 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
265 aa  145  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  34.47 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  36.76 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  39.39 
 
 
264 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
253 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  38.26 
 
 
255 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  34.85 
 
 
257 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
259 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  38.76 
 
 
248 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  36.47 
 
 
255 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 
251 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 
254 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  34.08 
 
 
256 aa  142  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  38.68 
 
 
244 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  36.11 
 
 
258 aa  142  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
255 aa  141  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
266 aa  141  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  35.47 
 
 
263 aa  141  9e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  36.64 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  33.08 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  35.66 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  35.63 
 
 
280 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  34.87 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.61 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.19 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  36.98 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
254 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  37.41 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  37.04 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  34.34 
 
 
257 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  34.8 
 
 
264 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  33.96 
 
 
257 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  37.78 
 
 
261 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  35.98 
 
 
259 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>