More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1420 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1402  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
279 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1420  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
279 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1456  alpha/beta hydrolase fold  98.84 
 
 
260 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648204  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  70.31 
 
 
260 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  74.12 
 
 
260 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  66.15 
 
 
261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  43.98 
 
 
268 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  45.77 
 
 
254 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  28.97 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  29.52 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  36.29 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  40.34 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.95 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  38.26 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  36.89 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  41.24 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  36.89 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  43.69 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  25.87 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  40.83 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  23.77 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  41.9 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  40.52 
 
 
456 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  22.63 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  24.3 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  39.82 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  31.2 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.47 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 
275 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 
275 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 
275 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  24.09 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  29.1 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
275 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 
298 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
268 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
340 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 
281 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
268 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.89 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  36.29 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  35.61 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
243 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  29.1 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0255  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  27.84 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  34.74 
 
 
341 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  21.81 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  35.79 
 
 
350 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>