More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2617 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  314  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  98.12 
 
 
160 aa  310  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  98.12 
 
 
160 aa  310  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  72.15 
 
 
159 aa  225  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  70.81 
 
 
163 aa  224  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  67.09 
 
 
159 aa  206  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  66.67 
 
 
159 aa  183  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  58.06 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  60.54 
 
 
153 aa  166  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  61.22 
 
 
157 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  59.03 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  52.83 
 
 
162 aa  153  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  53.02 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  51.3 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  46.84 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  47.26 
 
 
163 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  53.62 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
152 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.45 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  47.95 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  47.1 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  50.74 
 
 
144 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.9 
 
 
152 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 
146 aa  124  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  46.34 
 
 
150 aa  124  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.89 
 
 
152 aa  122  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 
147 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
150 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  45.53 
 
 
150 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 
147 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  47.86 
 
 
158 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 
147 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
163 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
154 aa  120  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 
150 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
150 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.72 
 
 
150 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.72 
 
 
150 aa  120  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  49.3 
 
 
169 aa  120  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
150 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
165 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  45.32 
 
 
146 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 
150 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
166 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  45.77 
 
 
143 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  50.37 
 
 
143 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  47.18 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  45.65 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  45.65 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  48.32 
 
 
153 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
150 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  43.79 
 
 
170 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
151 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
165 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 
164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 
152 aa  117  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
165 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
185 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
165 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  42.38 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  47.1 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  42.51 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
167 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
150 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
156 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
143 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
155 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 
145 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  48.3 
 
 
147 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  44.62 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
151 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.21 
 
 
162 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 
150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  49.17 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  41.5 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>