136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1590 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  48.16 
 
 
246 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  50 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.45 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.67 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.68 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.87 
 
 
253 aa  101  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.2 
 
 
280 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.17 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.94 
 
 
246 aa  92  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.82 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.54 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.36 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.07 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.83 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.48 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.1 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  26 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.21 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.97 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.67 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.97 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.17 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.07 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  29.13 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.52 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.67 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.71 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.5 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.61 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.27 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.95 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.92 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.51 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.32 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.22 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  27.9 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.83 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.39 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.38 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.04 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.78 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.65 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.41 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.82 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.59 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.34 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  29.22 
 
 
250 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  27.54 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.99 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.33 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.43 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.43 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  35.59 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.23 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  32.69 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.96 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  25.12 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.76 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  27.62 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.62 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  31.45 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  29.52 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  27.62 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.69 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.36 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  31.3 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  27.62 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.83 
 
 
290 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.65 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.48 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  28.57 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  28.57 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.51 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  28.57 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  28.57 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.65 
 
 
275 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  26.18 
 
 
258 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.31 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  30.88 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.04 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.77 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.04 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  27.05 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.29 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  27.18 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.4 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  29.51 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  24.79 
 
 
251 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.09 
 
 
251 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  29.06 
 
 
262 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  25.86 
 
 
249 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.24 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>