More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3856 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  69.96 
 
 
266 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  69.96 
 
 
266 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  69.96 
 
 
266 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  63.26 
 
 
268 aa  344  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  62.21 
 
 
288 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  59.92 
 
 
264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  56.87 
 
 
272 aa  321  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  54.96 
 
 
263 aa  321  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  53.82 
 
 
267 aa  309  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  52.29 
 
 
268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  53.23 
 
 
263 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  51.53 
 
 
267 aa  294  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  51.53 
 
 
267 aa  294  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  52.67 
 
 
267 aa  281  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  50.58 
 
 
274 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  50.38 
 
 
276 aa  275  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  49.42 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 
273 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  48.11 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 
269 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  45.04 
 
 
268 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  43.4 
 
 
269 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 
267 aa  242  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  42.97 
 
 
270 aa  241  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  43.03 
 
 
245 aa  235  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 
281 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
287 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  46.48 
 
 
282 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  43.53 
 
 
268 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.52 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.3 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  31.08 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.57 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  27.21 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.7 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  27.07 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  27.07 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.08 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  25.77 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  27.71 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  23.58 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
272 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.43 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  22.76 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  24.31 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  25.79 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  28.9 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  25.67 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25 
 
 
425 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  25.67 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  25.67 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  25.67 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  21.14 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  24.63 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.34 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  21.81 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>