94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1345 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  81.47 
 
 		 552 aa  867    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 554 aa  1095    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  35.53 
 
 		 553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.47 
 
 		 489 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.25 
 
 		 527 aa  207  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  30.75 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  24.48 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  21.67 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  21.87 
 
 		 523 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  22.45 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  27.1 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.33 
 
 		 579 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  26.92 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  29.42 
 
 		 587 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  27.35 
 
 		 539 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.95 
 
 		 522 aa  96.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.86 
 
 		 694 aa  93.6  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  33.02 
 
 		 423 aa  90.9  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  26.58 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  32 
 
 		 629 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  31.44 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1210 aa  74.3  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  32.18 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  30.84 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  24.04 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1016 aa  63.9  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.43 
 
 		 595 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  27.54 
 
 		 707 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.61 
 
 		 503 aa  55.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  25.26 
 
 		 526 aa  54.7  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3923  putative Vgr-related protein  33.09 
 
 		 626 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  28.98 
 
 		 677 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  24.34 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  21.47 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.76 
 
 		 730 aa  51.6  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  32.08 
 
 		 569 aa  51.6  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 493 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  27.67 
 
 		 633 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  25.77 
 
 		 481 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 450 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  25.93 
 
 		 691 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  26.56 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  26.78 
 
 		 523 aa  49.3  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  26.77 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 578 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  26.44 
 
 		 824 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.64 
 
 		 568 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  26.77 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.38 
 
 		 504 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 526 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  20.42 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 578 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  29.51 
 
 		 496 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  26.78 
 
 		 508 aa  48.5  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  28.05 
 
 		 680 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  29.41 
 
 		 275 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  29.51 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  24.43 
 
 		 520 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  28.33 
 
 		 498 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  24.43 
 
 		 520 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  25.51 
 
 		 494 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  25.12 
 
 		 810 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  25.85 
 
 		 499 aa  47.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  32.85 
 
 		 449 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26 
 
 		 1194 aa  47.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  24.87 
 
 		 489 aa  47  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  29.51 
 
 		 498 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  26.03 
 
 		 652 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 499 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  20.08 
 
 		 1285 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  24.71 
 
 		 557 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  22.42 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  23.53 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.38 
 
 		 816 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  25.13 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  26.63 
 
 		 486 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 478 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  23.3 
 
 		 809 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 		 478 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1036 aa  44.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1125 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  28.65 
 
 		 522 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 544 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.62 
 
 		 462 aa  44.3  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  23.68 
 
 		 501 aa  43.9  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  26.59 
 
 		 557 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  25.36 
 
 		 562 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.72 
 
 		 1159 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  28.07 
 
 		 505 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.16 
 
 		 808 aa  43.9  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  26.74 
 
 		 522 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>