182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl681 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl681  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
418 aa  847    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0868  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.67 
 
 
388 aa  420  1e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf881  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.16 
 
 
650 aa  120  3e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0707  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.98 
 
 
383 aa  104  3e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  26.05 
 
 
271 aa  72.4  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  27.98 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  25.53 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.36 
 
 
531 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  24.51 
 
 
252 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.94 
 
 
579 aa  64.7  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  25.35 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.37 
 
 
579 aa  63.2  0.000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.75 
 
 
517 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.76 
 
 
518 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  23.23 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  23.29 
 
 
350 aa  61.6  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  25.12 
 
 
542 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.38 
 
 
544 aa  60.5  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.4 
 
 
249 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  26.67 
 
 
553 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  24.41 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 
530 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  24.71 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 
528 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  25.48 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  27.65 
 
 
616 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 
530 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.11 
 
 
526 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  27.65 
 
 
616 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.37 
 
 
532 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  27.91 
 
 
614 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  22.53 
 
 
315 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  21.72 
 
 
314 aa  56.6  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  24.75 
 
 
551 aa  56.6  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  23.6 
 
 
223 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  32.88 
 
 
255 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  21.94 
 
 
291 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.03 
 
 
600 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  22.73 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.11 
 
 
532 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  22.66 
 
 
366 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  32.56 
 
 
255 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  21.09 
 
 
290 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  26.87 
 
 
324 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  36.59 
 
 
332 aa  53.5  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  24.75 
 
 
557 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  21.43 
 
 
260 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  21.43 
 
 
260 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  22.5 
 
 
548 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  30.3 
 
 
258 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  22.89 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  25.19 
 
 
278 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.02 
 
 
610 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.76 
 
 
632 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.4 
 
 
609 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  19.78 
 
 
335 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.11 
 
 
390 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  25.24 
 
 
617 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3943  60 kDa inner membrane insertion protein  35.16 
 
 
442 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  21.01 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  21.43 
 
 
260 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  23.81 
 
 
566 aa  51.2  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  25 
 
 
269 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.02 
 
 
610 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  29.55 
 
 
255 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  26.72 
 
 
583 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  21.01 
 
 
260 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  30.77 
 
 
255 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  30.77 
 
 
255 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  30.77 
 
 
255 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  30.77 
 
 
255 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  30.77 
 
 
255 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  22.41 
 
 
256 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  30.77 
 
 
255 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.27 
 
 
622 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  25.6 
 
 
609 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  21.15 
 
 
246 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  35.71 
 
 
291 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  24.58 
 
 
515 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  28.79 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  24.62 
 
 
543 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.58 
 
 
635 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  22.59 
 
 
257 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  20.59 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  27.61 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.14 
 
 
607 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  23.17 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  20.9 
 
 
560 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.32 
 
 
569 aa  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  20.59 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  20.59 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  20.59 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.12 
 
 
546 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  20.59 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.12 
 
 
546 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  23.79 
 
 
699 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  22.33 
 
 
539 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  25.49 
 
 
553 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  20.9 
 
 
560 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.12 
 
 
546 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>