262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0707 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0707  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
383 aa  777    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0868  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf881  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.39 
 
 
650 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl681  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.89 
 
 
418 aa  104  3e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  25.74 
 
 
566 aa  79.3  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.36 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  22.18 
 
 
514 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  24.31 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  29.07 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.83 
 
 
532 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.67 
 
 
530 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.4 
 
 
608 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  22.31 
 
 
252 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.67 
 
 
530 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  26.27 
 
 
255 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.4 
 
 
635 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.04 
 
 
528 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  26.39 
 
 
256 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  29.22 
 
 
699 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  22.13 
 
 
249 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  19.92 
 
 
532 aa  62.4  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  24.03 
 
 
604 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  22.6 
 
 
617 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46411  predicted protein  23.62 
 
 
467 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.56 
 
 
626 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  22.37 
 
 
609 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  22.89 
 
 
592 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  26.94 
 
 
224 aa  62  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  26.95 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.88 
 
 
628 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.42 
 
 
623 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  25.4 
 
 
553 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  23.79 
 
 
219 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  21.2 
 
 
518 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.42 
 
 
623 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.88 
 
 
569 aa  60.5  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  21.11 
 
 
566 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  23.08 
 
 
614 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  21.79 
 
 
261 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.83 
 
 
238 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3943  60 kDa inner membrane insertion protein  28.45 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  27.43 
 
 
255 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.81 
 
 
610 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  24.58 
 
 
255 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  24.58 
 
 
255 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  24.58 
 
 
255 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  24.58 
 
 
255 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  24.58 
 
 
255 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.81 
 
 
610 aa  59.7  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  25 
 
 
255 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1038  60 kDa inner membrane insertion protein  25.74 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0516206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  21.79 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.48 
 
 
238 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  25.4 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  26.58 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  22.12 
 
 
616 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  26.89 
 
 
255 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  27.87 
 
 
223 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.75 
 
 
609 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.47 
 
 
526 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  23.22 
 
 
616 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  21.46 
 
 
271 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  21.04 
 
 
565 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  26.58 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  25.33 
 
 
266 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  22.12 
 
 
605 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  29.55 
 
 
315 aa  57.4  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.32 
 
 
579 aa  57  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.57 
 
 
607 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  24.22 
 
 
314 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  23.02 
 
 
291 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  24.07 
 
 
589 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  21.27 
 
 
531 aa  57  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  23.95 
 
 
600 aa  56.6  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.81 
 
 
579 aa  56.6  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1565  60 kDa inner membrane insertion protein  24.88 
 
 
526 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150005  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  23.08 
 
 
604 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  25 
 
 
231 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  22.69 
 
 
278 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.63 
 
 
600 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  22.33 
 
 
624 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  24.02 
 
 
543 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  21.04 
 
 
564 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  25.42 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  22.12 
 
 
628 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.68 
 
 
565 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  23.08 
 
 
551 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  25 
 
 
544 aa  54.7  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4043  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.37 
 
 
571 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.695659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  24.11 
 
 
254 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  23.96 
 
 
583 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.86 
 
 
606 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  25.46 
 
 
217 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  20.5 
 
 
257 aa  53.5  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  20.65 
 
 
260 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.35 
 
 
616 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  20.65 
 
 
260 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  20.65 
 
 
260 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.77 
 
 
565 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.18 
 
 
548 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>