More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4125 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4125  HflK protein  100 
 
 		 515 aa  1020    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  42.55 
 
 		 387 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  39.64 
 
 		 360 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  41.13 
 
 		 361 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.46 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.47 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  38.38 
 
 		 405 aa  187  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  40.68 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  36.71 
 
 		 308 aa  183  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  39.22 
 
 		 407 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  36.36 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  39.02 
 
 		 378 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  38.97 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  37.5 
 
 		 309 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  37.78 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  36 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  37.27 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  37.41 
 
 		 382 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  38.37 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.13 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  37.72 
 
 		 413 aa  174  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  37.41 
 
 		 383 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  35.25 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  36.3 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  35.31 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  34.81 
 
 		 331 aa  170  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  35.48 
 
 		 379 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  36.84 
 
 		 359 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  35.13 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4127  HflK protein  38.25 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.848756  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  38.58 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  33.11 
 
 		 355 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  34.87 
 
 		 382 aa  167  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.16 
 
 		 395 aa  166  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  36.76 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.36 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  33.1 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.11 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  33.09 
 
 		 382 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  33.09 
 
 		 382 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  33.66 
 
 		 347 aa  161  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  34.41 
 
 		 390 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  35 
 
 		 397 aa  160  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  35 
 
 		 397 aa  160  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  34.53 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  37.12 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  33.01 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  35.96 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  34.62 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  33.7 
 
 		 306 aa  158  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.16 
 
 		 381 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  35.4 
 
 		 383 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  35.66 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  32.25 
 
 		 322 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  35.4 
 
 		 394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  33.92 
 
 		 389 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  34.56 
 
 		 435 aa  157  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  34.72 
 
 		 360 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  34.31 
 
 		 475 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  36.23 
 
 		 383 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  34.31 
 
 		 477 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  36.33 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  33.83 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  33.22 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  34.22 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  34.09 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  33.08 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  32.54 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  33.72 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  33.8 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  35.71 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  36.12 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  34.81 
 
 		 386 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  34.92 
 
 		 415 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  35.91 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  35.32 
 
 		 419 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  153  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  35.32 
 
 		 419 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  35.32 
 
 		 419 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3651  FtsH protease regulator HflK  36 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3796  FtsH protease regulator HflK  36 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0697  FtsH protease regulator HflK  36 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  34.5 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  35.94 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  35.94 
 
 		 380 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  34.5 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  34.92 
 
 		 421 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  34.5 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.58 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  34.5 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  33.98 
 
 		 418 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  34.77 
 
 		 381 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>