101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1199 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1199  helicase-like  100 
 
 		 460 aa  960    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00719413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3060  helicase domain protein  42.38 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1192  helicase domain-containing protein  43.11 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.44 
 
 		 753 aa  359  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.66 
 
 		 835 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.51 
 
 		 835 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.74 
 
 		 854 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0341  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.97 
 
 		 881 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.39 
 
 		 883 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2267  hypothetical protein  62.33 
 
 		 284 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  23.9 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  20.58 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  20.58 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.91 
 
 		 1110 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  23.71 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  36.17 
 
 		 1159 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  22.2 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  30.73 
 
 		 1071 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1088 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1088 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 1069 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  27 
 
 		 1068 aa  57  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  28.5 
 
 		 1068 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.55 
 
 		 1068 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 1091 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  21.81 
 
 		 513 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.29 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  21.77 
 
 		 1048 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 1068 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  25 
 
 		 1003 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.95 
 
 		 1028 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 1357 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  27.14 
 
 		 959 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  31.69 
 
 		 1096 aa  50.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  30.07 
 
 		 1163 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  23.32 
 
 		 1072 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  29.44 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.16 
 
 		 977 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  32.16 
 
 		 903 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  21.51 
 
 		 574 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 		 895 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  26.92 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  26.92 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  26.92 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  27.01 
 
 		 1013 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.34 
 
 		 1354 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  26.53 
 
 		 248 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.88 
 
 		 1102 aa  47.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 1102 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 633 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3020  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.09 
 
 		 465 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.93907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  26.6 
 
 		 1070 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  28.93 
 
 		 1064 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  25.99 
 
 		 1078 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  30.41 
 
 		 1019 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  29.07 
 
 		 886 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  21.22 
 
 		 917 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  27.42 
 
 		 1080 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  31.68 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2315  putative ATP-dependent RNA helicase  26.81 
 
 		 553 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 922 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 		 1082 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 1403 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21820  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.17 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.89 
 
 		 1227 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  27.16 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  29.26 
 
 		 1063 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27370  ATP-dependent RNA helicase  26.81 
 
 		 567 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.783828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  21.19 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  25.13 
 
 		 1073 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.8 
 
 		 1362 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  28.93 
 
 		 1064 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 		 1139 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  21.35 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  21.35 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 		 1047 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  27.16 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  19.21 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 982 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  22.28 
 
 		 709 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  28.22 
 
 		 1047 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  29.63 
 
 		 1033 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  27.23 
 
 		 1065 aa  43.9  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  20.93 
 
 		 658 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 1066 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 669 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.35 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  29.71 
 
 		 985 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  28.86 
 
 		 1040 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  28.43 
 
 		 1064 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  28.43 
 
 		 1064 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  25.62 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  23.28 
 
 		 1073 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  28.26 
 
 		 885 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  21.92 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  28.43 
 
 		 1064 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 1073 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 1073 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  21.35 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.28 
 
 		 1073 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>