More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0990 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.53 
 
 		 575 aa  749    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.1 
 
 		 594 aa  772    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.97 
 
 		 600 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.69 
 
 		 600 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  60.95 
 
 		 600 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  100 
 
 		 594 aa  1177    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.44 
 
 		 594 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  68.08 
 
 		 594 aa  769    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.8 
 
 		 600 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.05 
 
 		 610 aa  601  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.08 
 
 		 626 aa  595  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.59 
 
 		 613 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.78 
 
 		 613 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  55.44 
 
 		 613 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.42 
 
 		 633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.65 
 
 		 603 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.91 
 
 		 613 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.27 
 
 		 613 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.67 
 
 		 603 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  54.08 
 
 		 613 aa  555  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.48 
 
 		 605 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.93 
 
 		 597 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.56 
 
 		 611 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.73 
 
 		 611 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.56 
 
 		 611 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.08 
 
 		 597 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  46.35 
 
 		 606 aa  475  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.69 
 
 		 582 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.17 
 
 		 603 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.01 
 
 		 580 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.77 
 
 		 573 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.09 
 
 		 594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.3 
 
 		 583 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.37 
 
 		 603 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  48.13 
 
 		 583 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.13 
 
 		 583 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  46.32 
 
 		 585 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.57 
 
 		 589 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  39.09 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.24 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.33 
 
 		 588 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.13 
 
 		 619 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.82 
 
 		 605 aa  412  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.47 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.03 
 
 		 588 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  37.77 
 
 		 592 aa  362  9e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.71 
 
 		 573 aa  327  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.68 
 
 		 599 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.5 
 
 		 578 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.19 
 
 		 568 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.32 
 
 		 811 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.87 
 
 		 885 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.33 
 
 		 932 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  38.02 
 
 		 578 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.77 
 
 		 564 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.63 
 
 		 814 aa  303  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.38 
 
 		 788 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 574 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.41 
 
 		 573 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.41 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.75 
 
 		 785 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.92 
 
 		 574 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.41 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  33.04 
 
 		 568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.78 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.71 
 
 		 569 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.1 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.19 
 
 		 779 aa  281  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  36.46 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.94 
 
 		 831 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  36.46 
 
 		 577 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  36.46 
 
 		 577 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  36.46 
 
 		 577 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  36.46 
 
 		 577 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.39 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0958  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.18 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.388256  normal  0.0147257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.8 
 
 		 907 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.83 
 
 		 571 aa  278  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  39.86 
 
 		 565 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.51 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.51 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  36.64 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 577 aa  273  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.01 
 
 		 773 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.19 
 
 		 779 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.19 
 
 		 779 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.19 
 
 		 779 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 577 aa  273  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.68 
 
 		 779 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  34.46 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  29.95 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.01 
 
 		 779 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.14 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 827 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.19 
 
 		 779 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.02 
 
 		 779 aa  270  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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