More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0002 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 366 aa  724    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  73.64 
 
 		 361 aa  544  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0003  DNA polymerase III, beta subunit  46.2 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000000103313  normal  1 
 
 
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.27 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.67 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.93 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.3 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.63 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.13 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.69 
 
 		 367 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3063  DNA polymerase III, beta subunit  32.28 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.2 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.63 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 377 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  27.72 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.8 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.28 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.63 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.22 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.2 
 
 		 374 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  29.86 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  29.18 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.53 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  28.77 
 
 		 366 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.49 
 
 		 366 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  32.55 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  31.05 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  32.37 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.07 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.04 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.24 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  27.76 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 		 372 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.89 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.97 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.5 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.33 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  27.93 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  29.63 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  27.34 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.5 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  27.73 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.89 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  29.18 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  29.18 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.66 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.3 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.65 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.66 
 
 		 375 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  29.23 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.66 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  25.91 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.91 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.91 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.49 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  28 
 
 		 372 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  25.77 
 
 		 378 aa  135  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  25.77 
 
 		 378 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  29.71 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.71 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  28.16 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  25.78 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  27.76 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.78 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.78 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.13 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.78 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.78 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.31 
 
 		 366 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  25.26 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.91 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2688  DNA polymerase III, beta subunit  28.8 
 
 		 369 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0188688  hitchhiker  0.00114167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.41 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3715  DNA polymerase III, beta subunit  25.79 
 
 		 367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.348294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.18 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.29 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.32 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  25.42 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.06 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.68 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>