More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1156 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  100 
 
 		 503 aa  996    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  55 
 
 		 485 aa  520  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  45.95 
 
 		 508 aa  422  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  46.2 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  41.05 
 
 		 493 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  33.49 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  35.81 
 
 		 513 aa  220  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  32.35 
 
 		 480 aa  204  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  30.3 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  31.11 
 
 		 480 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  28.99 
 
 		 479 aa  199  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  31.38 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  31.47 
 
 		 480 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  28.9 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  31.06 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  31.33 
 
 		 481 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  32.54 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  33.95 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  30.74 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  33.33 
 
 		 467 aa  187  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  28.1 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  31.56 
 
 		 483 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  30.41 
 
 		 524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  33.58 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  31.58 
 
 		 487 aa  179  7e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  31.72 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  31.42 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  31.11 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  31.1 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  30.55 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  32.61 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  33.33 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  32.61 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  28.46 
 
 		 482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  31.62 
 
 		 480 aa  173  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  31.96 
 
 		 476 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  31.83 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  34.04 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  33.41 
 
 		 481 aa  170  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  32.37 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  29.11 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  32.85 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  30.86 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  32.37 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  32.48 
 
 		 481 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  30.02 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  32.94 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  30.23 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  31.96 
 
 		 484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  30.66 
 
 		 466 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  28.6 
 
 		 486 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  29.89 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  31.43 
 
 		 491 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  32.32 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  28.11 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  32.1 
 
 		 478 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  32.66 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  29.47 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  32.19 
 
 		 484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  30.07 
 
 		 482 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  32.43 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.97 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  30.75 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  31.03 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  31.01 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  30.77 
 
 		 485 aa  153  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  26.87 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  32.35 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  31.8 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  29.13 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  30.33 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  31.73 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  28.09 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  31.35 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  29.5 
 
 		 481 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  30.98 
 
 		 486 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  29.24 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  32.35 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  30.19 
 
 		 498 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  31.64 
 
 		 500 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  30.77 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  28.54 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  30.56 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  30.56 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  31.64 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  27.51 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  30.15 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  32.86 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  30.93 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  31.1 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  30.93 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  28.21 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  30.34 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  29.23 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  30.67 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  30.49 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  32.03 
 
 		 483 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  30.06 
 
 		 482 aa  144  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  28.73 
 
 		 488 aa  143  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  29.84 
 
 		 483 aa  143  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>