More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1004 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 313 aa  634    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  64.86 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  53.53 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  54.83 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  54.7 
 
 		 326 aa  298  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  50.69 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  50.69 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  47.14 
 
 		 319 aa  251  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  47.7 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  46.23 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  47.4 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  45.67 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  43.55 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  44.19 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  42.9 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.2 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  36.6 
 
 		 340 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  33.9 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  33.9 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  41.54 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  35.15 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  38.49 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  35.86 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  35.55 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  39.32 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  36.07 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  35.86 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  38.43 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  38.43 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  34.12 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  34.38 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 331 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  36.27 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  35.94 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  35.16 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 		 324 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  36.33 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.55 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  32.88 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  37.55 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  38.98 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  34.46 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.12 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  33.22 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  34.52 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  37.35 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35.57 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  37.7 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.97 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  35.29 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.83 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  34.93 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.89 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.98 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  35.77 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  32.89 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  32.08 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  30.29 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  34.33 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  34.82 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  32.27 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  32.79 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  36.19 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  34.84 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  31.49 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  34.39 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  34.05 
 
 		 330 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.01 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  36.69 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  30.49 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  34.84 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  32.99 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 339 aa  122  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  32.78 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  36.3 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  35.95 
 
 		 382 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  34.43 
 
 		 351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>