More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4221 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4221  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  633    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565673  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  31.02 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  33.82 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  31.27 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1161  hypothetical protein  30.83 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000162598  normal  0.390366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  28.04 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  32.29 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  30.87 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  30.74 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  32.63 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  29.39 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  29.51 
 
 		 322 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  33.1 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  30.11 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.63 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  32.53 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  31.05 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  31.77 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  31.8 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  30.39 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  31.42 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0623  hypothetical protein  29.62 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  29.47 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  29.45 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  28.41 
 
 		 326 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  29.69 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  28.9 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  32.44 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  29.45 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  30.31 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  28.16 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  28.91 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  28.91 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  30.85 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  29.35 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2450  hypothetical protein  27.27 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  27.42 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  29.59 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  31.05 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  29.75 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  28.68 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  33.61 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2926  hypothetical protein  30.04 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  27.46 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  29.04 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  29.67 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  27.1 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  29.18 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  30.42 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  30.77 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  32.24 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  28.41 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  30.46 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  28.62 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1911  hypothetical protein  30.18 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248685  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  29.39 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  28.71 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  28.38 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  28.26 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  28.75 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  28.75 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  30.77 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  28.28 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0715  hypothetical protein  32.62 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  29.66 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  27.56 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  30.2 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  27.6 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  28.79 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  26.32 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  26.87 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  30.18 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  25.16 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  28.39 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  27.12 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  26.93 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  30.29 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  28 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  27.06 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  27.81 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  29.89 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  26.62 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0291  hypothetical protein  29.58 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  29.1 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  29.79 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  30.88 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  28.14 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  30.56 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  29.26 
 
 		 353 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  29.96 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  27.46 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  28.36 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  27.95 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  28.12 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  29.48 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>