More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0115 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  100 
 
 		 334 aa  673    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  62.97 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  54.19 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  39.18 
 
 		 348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2172  Peptidase M23  32.22 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2234  Peptidase M23  32.22 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.417932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  39.32 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  34.31 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  31.61 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  32.16 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  30.73 
 
 		 592 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  42.68 
 
 		 640 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  40.24 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  40.4 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  41.79 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  34.78 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  41.25 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  35.4 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  44.71 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  49.23 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  39.56 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  34.78 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  45.45 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  45.45 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  45.45 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  38.74 
 
 		 464 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  45.24 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  45.45 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  45.24 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.39 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34.21 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  36.73 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  36.78 
 
 		 453 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  36.73 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  36.96 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  41.94 
 
 		 502 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  36.79 
 
 		 621 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  40.3 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  40.26 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  48.53 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  40.51 
 
 		 524 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.78 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  36 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  40.24 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  40.24 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  34.38 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  31.36 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  39.51 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  33.85 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.59 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  36.59 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  33.67 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  40.51 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  43.94 
 
 		 649 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  34.31 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  31.39 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  37.63 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  40.2 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  42.25 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  40.3 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  44.44 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  40 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  29.71 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  35.51 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  31.39 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  35.51 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  37.38 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  42.42 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  35.51 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  35.51 
 
 		 471 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  37.88 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  29.2 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32.77 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  38.81 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  36 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  35.51 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  41.1 
 
 		 676 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  35.37 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  39.74 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.91 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  37.31 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  42.03 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  41.54 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  41.18 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  35.25 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  39.74 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  37.8 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  35 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  44.62 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  34.21 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.93 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1247  Peptidase M23  42.05 
 
 		 791 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  39.02 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  31.21 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  39.13 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  43.08 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  39.13 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  33.65 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  39.6 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  31.82 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>