62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3361 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  61.26 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  55.91 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  29.82 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  29.87 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  31.48 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  25.11 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  28.51 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  26.61 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  28.79 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  25.45 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  24.41 
 
 		 167 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  28.46 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  28.32 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  25.18 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  27.59 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  27.61 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  21.43 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.07 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  21.97 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  29.1 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  24.59 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  24.23 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  23.89 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  21.43 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 485 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1733  hypothetical protein  25.88 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0103078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  20.45 
 
 		 175 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  22.56 
 
 		 385 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 		 109 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  26.32 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 120 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  40.43 
 
 		 109 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  30.59 
 
 		 113 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 118 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  25.37 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 107 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  26.25 
 
 		 109 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 120 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  32.76 
 
 		 110 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 109 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  26.19 
 
 		 103 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 108 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  29.85 
 
 		 109 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  32.08 
 
 		 117 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 109 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  41.03 
 
 		 145 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>