More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3067 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  683    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  60.53 
 
 
349 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  56.18 
 
 
342 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  36.92 
 
 
361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  34.74 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  31.75 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  32.07 
 
 
369 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  31.98 
 
 
369 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  31.98 
 
 
369 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  32.07 
 
 
369 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  30.88 
 
 
368 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  30.68 
 
 
358 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  29.6 
 
 
350 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  31.14 
 
 
368 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  30.97 
 
 
360 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  31.44 
 
 
368 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  31.44 
 
 
368 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  30.45 
 
 
368 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  30.12 
 
 
345 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  30.36 
 
 
359 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  31.52 
 
 
404 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  30.09 
 
 
394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  32.56 
 
 
359 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  31.49 
 
 
358 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  30.72 
 
 
354 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  31.8 
 
 
406 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  29.07 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  31.45 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  31.79 
 
 
351 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  30.62 
 
 
372 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  31.99 
 
 
350 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  30 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  33.84 
 
 
362 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  28.87 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  28.11 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  31.49 
 
 
354 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  31.82 
 
 
352 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  31.82 
 
 
352 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  31.82 
 
 
352 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  30.21 
 
 
349 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  28 
 
 
350 aa  136  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  30.55 
 
 
344 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  29.64 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  29.64 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  29.64 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  31.73 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  30.12 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  30.12 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  30.12 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  29.32 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  30.12 
 
 
349 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  29.18 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  29.18 
 
 
349 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  29.18 
 
 
349 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  29.18 
 
 
349 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  29.18 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  29.18 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  29.18 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  29.18 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  28.3 
 
 
348 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  29.78 
 
 
336 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  26.03 
 
 
438 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  28.53 
 
 
350 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  28.61 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  24.24 
 
 
398 aa  116  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  28.97 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  30.65 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  30.65 
 
 
344 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  30.65 
 
 
344 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  30.65 
 
 
344 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  30.65 
 
 
344 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  30.65 
 
 
344 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  30.65 
 
 
344 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  30.32 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  30.32 
 
 
344 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  29.21 
 
 
373 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 
409 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  27.22 
 
 
351 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  26.73 
 
 
380 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  27.27 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1957  hypothetical protein  29.01 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654804  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  22.95 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  25.99 
 
 
338 aa  92.8  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  27.59 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  27.59 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  24.15 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 
359 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  24.06 
 
 
359 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2135  protein of unknown function UPF0118  26.12 
 
 
443 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  34.93 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  32.05 
 
 
348 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  38.14 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  27.13 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1228  hypothetical protein  27.59 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3619  hypothetical protein  24.15 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542852  normal  0.0156067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0864  protein of unknown function UPF0118  36.44 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407336  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  30.15 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>