More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2165 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  65.17 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  51.4 
 
 		 292 aa  285  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  49.31 
 
 		 288 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  48.26 
 
 		 293 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  45.8 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  45.3 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  44.98 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  41.67 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  40.62 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  40.97 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  39.12 
 
 		 302 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  38.54 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  49.71 
 
 		 177 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  48 
 
 		 177 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  50.91 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  49.14 
 
 		 177 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  33.9 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  48.57 
 
 		 177 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  45.71 
 
 		 177 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  42.42 
 
 		 173 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  30.95 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  27.97 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  29.39 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  29.58 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  28.17 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  28.98 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  32.12 
 
 		 176 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  33.94 
 
 		 178 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  30.54 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.79 
 
 		 909 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  43.53 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  35.34 
 
 		 907 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.67 
 
 		 877 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  35.09 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.95 
 
 		 873 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  32.8 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32 
 
 		 867 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.67 
 
 		 877 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 873 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  33.33 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  31.62 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.51 
 
 		 845 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.51 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.21 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  31.78 
 
 		 904 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.5 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  40.24 
 
 		 879 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  40.24 
 
 		 879 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  28.21 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.63 
 
 		 907 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.59 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  32.46 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  32 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  29.41 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 		 885 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.91 
 
 		 903 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  30.7 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  31.21 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  28.7 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  28.45 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.33 
 
 		 769 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 		 613 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  32.76 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  27.78 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  31.2 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  27.13 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.47 
 
 		 710 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.33 
 
 		 863 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  34.74 
 
 		 511 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  26.35 
 
 		 627 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  25.9 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.39 
 
 		 880 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  30.58 
 
 		 136 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.89 
 
 		 191 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  27.73 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  29.63 
 
 		 155 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  28.7 
 
 		 412 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  32.76 
 
 		 513 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30 
 
 		 897 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  38.55 
 
 		 698 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  29.6 
 
 		 618 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 141 aa  52.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  34.15 
 
 		 875 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  31.85 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  35.42 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  28.07 
 
 		 145 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  27.83 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 863 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.61 
 
 		 605 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 		 875 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1016  diguanylate cyclase  29.03 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.09 
 
 		 909 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  29.29 
 
 		 502 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>