More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1438 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  100 
 
 		 365 aa  736    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  69.86 
 
 		 366 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  65.48 
 
 		 373 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  60.96 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  57.22 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  59.83 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  59.55 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  53.35 
 
 		 377 aa  411  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  56.62 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  56.62 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  56.78 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  54.78 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  51.2 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  56.66 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  53.91 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  50.97 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  49.17 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  51.84 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  54.11 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  53.41 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  56.06 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  53.52 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  55.08 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  363  4e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  55.21 
 
 		 362 aa  362  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  53.24 
 
 		 373 aa  362  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  54.8 
 
 		 362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  56.39 
 
 		 354 aa  362  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  53.67 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  54.57 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  54.52 
 
 		 362 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  52.16 
 
 		 386 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  52.41 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  52.69 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  52.68 
 
 		 361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  55.65 
 
 		 367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  52.63 
 
 		 391 aa  355  5e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  51.27 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  51.12 
 
 		 360 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  51.12 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  51.87 
 
 		 384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  52.68 
 
 		 361 aa  352  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  52.39 
 
 		 359 aa  352  8e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  50.85 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  51.14 
 
 		 365 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  52.11 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  52.68 
 
 		 366 aa  347  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  53.26 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  51.67 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  54.5 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  50.99 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  52.68 
 
 		 366 aa  346  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  50.84 
 
 		 371 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  49.86 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  51.38 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  51.69 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  53.93 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  53.93 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  53.93 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  53.93 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  51.38 
 
 		 361 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  53.93 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  53.93 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  53.93 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  53.93 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  50.99 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  51.89 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  50.99 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  50.13 
 
 		 366 aa  342  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  50.7 
 
 		 362 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  51.25 
 
 		 371 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  50.83 
 
 		 361 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  50.99 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  51.4 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  52.39 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  50.97 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  53.43 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  52.11 
 
 		 352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  51.12 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  52.1 
 
 		 442 aa  339  4e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  53.52 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  53.52 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  53.52 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  53.52 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  53.52 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  52.1 
 
 		 367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  50.14 
 
 		 365 aa  338  5.9999999999999996e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  49.86 
 
 		 373 aa  338  7e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  52.65 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  53.65 
 
 		 361 aa  338  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  51.4 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  50.71 
 
 		 361 aa  337  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  50.41 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  49.44 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  52.96 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  52.38 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  53.37 
 
 		 361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  49.3 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>