More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0545 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  100 
 
 
969 aa  1984    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  33.07 
 
 
1523 aa  288  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.1 
 
 
1454 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  33.63 
 
 
1280 aa  277  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  32.64 
 
 
1484 aa  254  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  34.57 
 
 
1438 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  35.44 
 
 
1416 aa  157  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  37.55 
 
 
728 aa  144  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  29.1 
 
 
1144 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4989  NB-ARC  29.2 
 
 
1243 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.700423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  48.41 
 
 
505 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.88 
 
 
792 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  43.31 
 
 
1236 aa  101  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  39.26 
 
 
790 aa  98.6  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.65 
 
 
1163 aa  98.6  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.53 
 
 
676 aa  98.2  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.28 
 
 
677 aa  97.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  35.88 
 
 
954 aa  96.3  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  42.74 
 
 
1363 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  39.84 
 
 
1652 aa  95.1  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3131  NB-ARC domain-containing protein  27.08 
 
 
399 aa  94.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  40.62 
 
 
346 aa  94.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  40.32 
 
 
947 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  41.41 
 
 
1364 aa  92.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.86 
 
 
692 aa  92.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  42.62 
 
 
687 aa  91.3  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  37.82 
 
 
540 aa  91.3  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  41.46 
 
 
657 aa  89.7  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.36 
 
 
696 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.46 
 
 
682 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  36.72 
 
 
1868 aa  89.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.88 
 
 
1557 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  36.59 
 
 
1188 aa  87.8  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  38.1 
 
 
334 aa  86.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.22 
 
 
608 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.29 
 
 
698 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  38.84 
 
 
1247 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  40.65 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  34.62 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  23.78 
 
 
1427 aa  85.5  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.94 
 
 
1686 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  35 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  35 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  41.13 
 
 
589 aa  84.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  36.64 
 
 
774 aa  84.3  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.07 
 
 
930 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
1443 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.07 
 
 
664 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.11 
 
 
1240 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  39.34 
 
 
1858 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  39.06 
 
 
1016 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 
1190 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  34.68 
 
 
1193 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.5 
 
 
1481 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  32.28 
 
 
1213 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  35.42 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  39.06 
 
 
1016 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.93 
 
 
742 aa  81.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  35.88 
 
 
778 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.97 
 
 
1367 aa  81.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.61 
 
 
1626 aa  81.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  39.02 
 
 
826 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.01 
 
 
1598 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  38.58 
 
 
1474 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  35.44 
 
 
1330 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  38.66 
 
 
317 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.01 
 
 
1609 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  38.71 
 
 
597 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  35.43 
 
 
652 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  36.72 
 
 
578 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.59 
 
 
1267 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  34.62 
 
 
772 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.79 
 
 
1398 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  40.34 
 
 
1553 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  37.69 
 
 
1599 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.48 
 
 
1607 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  34.62 
 
 
772 aa  79.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.79 
 
 
596 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.6 
 
 
1856 aa  79  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.82 
 
 
1211 aa  78.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.54 
 
 
576 aa  78.2  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 
1878 aa  77.8  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 
577 aa  77.8  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.03 
 
 
1196 aa  77.8  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  30.47 
 
 
1221 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.93 
 
 
1242 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19794  Receptor of activated protein kinase C 1A, component of 40S small ribosomal subunit  35.61 
 
 
321 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48240  Receptor of activated protein kinase C 1B, component of 40S small ribosomal subunit  35.61 
 
 
321 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  29.71 
 
 
405 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  33.83 
 
 
564 aa  77  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.87 
 
 
1357 aa  77  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.28 
 
 
1711 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
1831 aa  77  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  34.59 
 
 
1348 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  37.5 
 
 
1209 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  34.43 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  34.68 
 
 
1161 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  35.48 
 
 
1176 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.33 
 
 
675 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  33.85 
 
 
1789 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>