87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0422 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  37.18 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  35.9 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  34.57 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  30.38 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  35.44 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  31.33 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  30.12 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  33.75 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.75 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  33.73 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.9 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  36.25 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  27.27 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  30 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  28.75 
 
 		 384 aa  52.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  29.49 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  28.74 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  28.38 
 
 		 93 aa  50.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  28.57 
 
 		 383 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  34.57 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  30.53 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  28.05 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  32.5 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  27.91 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  28.4 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  27.38 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  30.38 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  26.58 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32.91 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  25.64 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  25.97 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  27.5 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  28.24 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  30 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  28.75 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  30.12 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  34.72 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.17 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  26.25 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  24.69 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  36.36 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  28.57 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  33.33 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  26.58 
 
 		 266 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  29.49 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  28.24 
 
 		 97 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  32.56 
 
 		 121 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  25.58 
 
 		 91 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  24.36 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  28.26 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  24.36 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  30 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  29.87 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  29.87 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  32.56 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  22.78 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  37.68 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  29.17 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  28.57 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>