189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0359 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  100 
 
 		 776 aa  1561    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  35.7 
 
 		 479 aa  288  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  50.21 
 
 		 485 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  57.46 
 
 		 436 aa  180  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  56.39 
 
 		 421 aa  176  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  57.14 
 
 		 469 aa  168  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  35.09 
 
 		 488 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  41.43 
 
 		 404 aa  122  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.11 
 
 		 382 aa  101  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  37.98 
 
 		 381 aa  97.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  32.8 
 
 		 397 aa  83.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  34.31 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  32.35 
 
 		 375 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  32.85 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  33.1 
 
 		 372 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  37.21 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  41.28 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  38.95 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  36.45 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  38.32 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  36.45 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  31.06 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  40.57 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  25.07 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  36.94 
 
 		 418 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  26.69 
 
 		 392 aa  67  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  30.97 
 
 		 379 aa  66.6  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  22.73 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  31.82 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  24.16 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  23.65 
 
 		 428 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  42.39 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  37.14 
 
 		 423 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  42.39 
 
 		 415 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  39.13 
 
 		 374 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  39.08 
 
 		 379 aa  60.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  41.3 
 
 		 415 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  24.69 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  23.68 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  38.04 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  29.45 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  37.63 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  32.06 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1751  metallophosphoesterase  38.46 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  32.61 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  30.83 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  31.39 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43144  predicted protein  25.44 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  0.938333 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  37.63 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  37.36 
 
 		 376 aa  57.4  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  37.21 
 
 		 386 aa  57  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  23.97 
 
 		 354 aa  56.6  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  35.87 
 
 		 386 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  38.78 
 
 		 455 aa  56.6  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  31.45 
 
 		 366 aa  55.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  35.48 
 
 		 415 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  33.61 
 
 		 412 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  35.26 
 
 		 417 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 464 aa  54.7  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  36.78 
 
 		 395 aa  54.3  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  31.73 
 
 		 420 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  34.62 
 
 		 419 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  31.58 
 
 		 417 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  33.65 
 
 		 428 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  32.99 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  41.67 
 
 		 270 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  28.37 
 
 		 384 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  37.63 
 
 		 372 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  35.48 
 
 		 386 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 372 aa  52.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  24.18 
 
 		 377 aa  52.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 430 aa  52.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  23.93 
 
 		 381 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  30.53 
 
 		 418 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  32.43 
 
 		 381 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.62 
 
 		 428 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  34.48 
 
 		 425 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  33 
 
 		 412 aa  51.6  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  32.09 
 
 		 382 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  21.64 
 
 		 414 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  31.31 
 
 		 432 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  33.05 
 
 		 390 aa  51.6  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  31.31 
 
 		 432 aa  51.2  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  37 
 
 		 406 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  36.78 
 
 		 388 aa  51.2  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.34 
 
 		 386 aa  50.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2554  metallophosphoesterase  29.35 
 
 		 515 aa  50.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  21.97 
 
 		 379 aa  50.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  31.96 
 
 		 413 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  30.3 
 
 		 432 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  35.79 
 
 		 382 aa  50.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  34.83 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  49.18 
 
 		 370 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  29.9 
 
 		 413 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  30.93 
 
 		 413 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  35.79 
 
 		 382 aa  50.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  28.71 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  31.31 
 
 		 537 aa  50.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  30.07 
 
 		 405 aa  50.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  34.11 
 
 		 423 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>