93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0628 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0628  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.253197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  29.41 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  28.48 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  30 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  31.21 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  29.17 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  29.66 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  28.37 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  28.37 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  26.06 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  28.28 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  27.4 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  28.28 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  26.9 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  26.9 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  27.59 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  25.16 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  25.62 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  25.53 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  25.53 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  27.22 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  29.41 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  26.83 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  28.07 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  25.64 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  27.07 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  27.05 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0332  LemA family  27.64 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  26.8 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  26.24 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  26.24 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  26.24 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  24.85 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  26.95 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  23.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  23.64 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  26.9 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  22.81 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  26.43 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  26.43 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  26.34 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  24.4 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  24.18 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  25.9 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  26.4 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  22.93 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0120  LemA family protein  23.4 
 
 		 182 aa  48.9  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000229196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  25.17 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf801  conserved hypothetical membrane protein LemA  26.67 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  25.68 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  25.81 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  27.03 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  25.9 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  24.82 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  25 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  26.49 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  25.35 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  26.23 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  26.23 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  23.18 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  23.03 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  27.16 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  25.34 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  22.64 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  22.01 
 
 		 184 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  23.13 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  22.42 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  22.88 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  25 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5399  LemA family protein  26.6 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2447  LemA family protein  23.88 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.977457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  22.93 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  25.58 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  24.39 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  20.44 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  24.84 
 
 		 434 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  21.3 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2251  LemA family protein  22.49 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  22.12 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  25.34 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  22.22 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  24.28 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  22.6 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  24.44 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28080  hypothetical protein  40.3 
 
 		 132 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  24.07 
 
 		 433 aa  42  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  22.76 
 
 		 187 aa  42  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  24.48 
 
 		 190 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  29.11 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  21.18 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  27.54 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  24.11 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>