112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1192 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1192  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0736084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  38.18 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  37.96 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  32.17 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  34.58 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  30.77 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.73 
 
 		 334 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.73 
 
 		 351 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  34.09 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  30.36 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  35.63 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  35.63 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  34.09 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  34.09 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  34.09 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  34.09 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  34.09 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  35.63 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  35.63 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  31.54 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  35.63 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  36.11 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  23.91 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  34.09 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  31.9 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  24.24 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  28.33 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  26.72 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  31.03 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  30.43 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  28.8 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  29.79 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.81 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  28.23 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  27.42 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  32.71 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  34.09 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  31.07 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  30.56 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  29.52 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  29.55 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  29.55 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  32.93 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  27.59 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  34.09 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  32.5 
 
 		 328 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  29.55 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  29.55 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  29.66 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  27.62 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  31.63 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  27.88 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  30.48 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  30.47 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  32.08 
 
 		 365 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  31.13 
 
 		 357 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1115  protein of unknown function DUF461  30.65 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  31.82 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  31.13 
 
 		 357 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  26.85 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  29.46 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  29.7 
 
 		 227 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  28.21 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  32.95 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  34.55 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  31.9 
 
 		 321 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  29.82 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  29.03 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  25.87 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  24.82 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  28.18 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  27.61 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  32.47 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  28.95 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  23.08 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  31.37 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  29.91 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  22.83 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  27.1 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  30.77 
 
 		 320 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  21.48 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  28.45 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  27.1 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  25.23 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  27.03 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  26.17 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  26.43 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  31.19 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>