223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0413 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  42.13 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  44.25 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  41.18 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  44.32 
 
 		 205 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  42.05 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  40.35 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  42.61 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  43.2 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  39.77 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  41.48 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  39.56 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  40.57 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  43.1 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  40.34 
 
 		 218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  41.48 
 
 		 216 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  39.88 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  40.46 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  44 
 
 		 213 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  42.93 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  39.64 
 
 		 192 aa  127  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  39.52 
 
 		 214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  40.34 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  37.64 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  39.2 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  42.94 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  39.2 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  40.91 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  40.91 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  38.69 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  36.9 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  42.94 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  39.77 
 
 		 210 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  40.68 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  39.77 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  39.29 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  41.18 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  37.43 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  45.03 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  36.63 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  39.41 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  38.07 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  35.59 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  41.18 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  40.59 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  37.71 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  41.18 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  40.59 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  36.32 
 
 		 200 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  36.32 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  35.88 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  38.37 
 
 		 205 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  37.43 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  37.16 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  35.88 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  43.71 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  35.88 
 
 		 216 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  43.05 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  38.15 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  37.43 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  37.43 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  36.26 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  41.61 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  40 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  37.06 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  36.75 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  37.43 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  36.26 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  37.21 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  35.84 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  38.51 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  34.66 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  32.95 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  35.84 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0062  hypothetical protein  36.63 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  39.43 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  36.09 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  36.47 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  36.78 
 
 		 192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  36.78 
 
 		 192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0057  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  38.64 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  36.31 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  35.88 
 
 		 211 aa  110  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  35.88 
 
 		 211 aa  110  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  35.88 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>