More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03337 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  46.28 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  46.21 
 
 		 344 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  49.14 
 
 		 334 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  41.09 
 
 		 327 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.34 
 
 		 342 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.8 
 
 		 331 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  43.33 
 
 		 376 aa  103  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 338 aa  103  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.46 
 
 		 335 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  47.83 
 
 		 334 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.15 
 
 		 331 aa  100  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  44.44 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 331 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  43.97 
 
 		 334 aa  100  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 331 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 331 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  41.32 
 
 		 331 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 331 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 331 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  39.67 
 
 		 331 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.67 
 
 		 331 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 331 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 331 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 331 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  41.67 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 331 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  42.74 
 
 		 334 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.15 
 
 		 331 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.37 
 
 		 330 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  42.74 
 
 		 334 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  41.67 
 
 		 184 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  41.67 
 
 		 208 aa  95.9  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  41.67 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  41.67 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  41.67 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  41.67 
 
 		 208 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  37.61 
 
 		 322 aa  94.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  40 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  41.74 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  38.02 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 346 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  38.84 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  37.07 
 
 		 344 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  38.33 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  38.33 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  38.33 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  43.7 
 
 		 331 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  38.33 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  38.33 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  40.5 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.58 
 
 		 333 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  40.71 
 
 		 339 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.76 
 
 		 352 aa  80.9  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2284  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  35.04 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3269  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 467 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 321 aa  73.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  37.93 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  36.07 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 377 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1979  response regulator of RpoS  34.91 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2280  response regulator of RpoS  35.85 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0432  putative two-component regulator  31.13 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  36.11 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 782 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1660  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  37.04 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2553  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1194499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1082  response regulator  35.51 
 
 		 367 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 542 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2737  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00154696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>