More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01791 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  47.34 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  47.6 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  47.85 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  47.37 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  48.77 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  43.13 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  43.13 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  44.98 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.71 
 
 		 197 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  44.1 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  44.1 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  44.1 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  44.1 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  43.43 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  44.79 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  42.79 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  41.83 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  44.76 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  44.08 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.97 
 
 		 349 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.97 
 
 		 349 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  43.01 
 
 		 342 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 378 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.97 
 
 		 349 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.45 
 
 		 349 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.27 
 
 		 413 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 343 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 346 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  41.45 
 
 		 342 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  41.98 
 
 		 369 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 		 369 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.89 
 
 		 354 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  41.51 
 
 		 369 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 341 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6603  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 351 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 376 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.59 
 
 		 354 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  40.53 
 
 		 361 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.78 
 
 		 378 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.93 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.23 
 
 		 389 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  44.78 
 
 		 332 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  40.96 
 
 		 369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 341 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.98 
 
 		 348 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.92 
 
 		 378 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.67 
 
 		 377 aa  139  3.9999999999999997e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 352 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  40.49 
 
 		 343 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 378 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  40.53 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40.41 
 
 		 349 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  40.41 
 
 		 349 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 378 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.58 
 
 		 356 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 378 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 378 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 378 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 343 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 349 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  43.55 
 
 		 363 aa  137  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 378 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 378 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 378 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  39.8 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  39.69 
 
 		 343 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 		 356 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  41.45 
 
 		 342 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 		 356 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.69 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.69 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.69 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.69 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  41.97 
 
 		 1057 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.9 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.24 
 
 		 378 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.69 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.69 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  40.41 
 
 		 349 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 		 333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  40.57 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2794  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.69 
 
 		 365 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.44 
 
 		 352 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  42.63 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  40.21 
 
 		 390 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.69 
 
 		 364 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  36.89 
 
 		 352 aa  135  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 		 353 aa  135  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.54 
 
 		 347 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  40.21 
 
 		 338 aa  135  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.72 
 
 		 364 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.72 
 
 		 364 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>