112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01626 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01626  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 		 314 aa  634    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0517  cobalamin biosynthesis protein CbiB  35.14 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0854  CobD-related protein  29.78 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00922  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.51 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004472  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.78 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3138  cobalamin biosynthesis protein CbiB  29.44 
 
 		 329 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.645518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1252  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.23 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1321  CobD-related protein  26.61 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2566  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.15 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000687479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1219  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.74 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1133  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.61 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.339799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1114  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.09 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3053  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.81 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0327642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2957  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.948861  normal  0.0341254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1958  adenosylcobinamide-phosphate synthase  25.84 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1216  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.74 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2875  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.6 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0980593  hitchhiker  0.000833797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1000  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.27 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2967  CobD-related protein  25.38 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1026  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.01 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188551  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4742  cobD/cbiB family protein  27.78 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  27.71 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  27.11 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  25.1 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  24.35 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  27.95 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2802  CobD-related protein  23.81 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  27.31 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  28.02 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  27.31 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  25.1 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  24.33 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  27.31 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  26.94 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  26.52 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  25.19 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  24.01 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  24.43 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  24.63 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  27.07 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  26.14 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  26.17 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.66 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.38 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  23.85 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  24.82 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  26.61 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  22.14 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  25 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  25.47 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  24.41 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  24.14 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  23.55 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  28.47 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  22.89 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  22.56 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  27.21 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  25.76 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  23.19 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  22.39 
 
 		 332 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  26.22 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  27.44 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.33 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  27.01 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  27.62 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.8 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0969  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.31 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  27.78 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.92 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.5 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0663  cobalamin biosynthesis protein  23.36 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1539  cobalamin biosynthesis protein  32.94 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0861837 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  26.2 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.29 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  27.04 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.72 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  21.97 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  21.71 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  25.56 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1529  adenosylcobinamide-phosphate synthase  23.46 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.292471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  26.26 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.39 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1131  cobalamin biosynthesis protein CobD  22 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  25.49 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.42 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.18 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  30.68 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  22.97 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.05 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  22.17 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  25 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  29.13 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  23.68 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>