201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00922 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00922  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 		 331 aa  663    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004472  adenosylcobinamide-phosphate synthase  74.45 
 
 		 317 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1958  adenosylcobinamide-phosphate synthase  63.72 
 
 		 317 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2566  adenosylcobinamide-phosphate synthase  52.6 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000687479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0517  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.62 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1114  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.05 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1216  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.57 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0854  CobD-related protein  27.42 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1321  CobD-related protein  27.71 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  26.37 
 
 		 304 aa  96.3  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01626  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.55 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1000  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.91 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3053  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.31 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0327642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  28.62 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.65 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1133  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.82 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.339799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2875  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.8 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0980593  hitchhiker  0.000833797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2957  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.8 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.948861  normal  0.0341254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  27.24 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  23.1 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  22.86 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  25.27 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  25.36 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3138  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.67 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.645518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2967  CobD-related protein  24.92 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  22.14 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  25.36 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1252  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.29 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  23.65 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  26.29 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  24.81 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  24.55 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  24.1 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  24.81 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1026  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.03 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188551  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  25.77 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  22.79 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  23.97 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  23.97 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  23.97 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4742  cobD/cbiB family protein  28.92 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1219  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.19 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  22.43 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.94 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  27.02 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2802  CobD-related protein  29.69 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  26.49 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  26.9 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  25.57 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  26.9 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  26.9 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  23.58 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  26.9 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  24.64 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  25.89 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  26.32 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  25.89 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  25.89 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  22.61 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  25.84 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  25.84 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  26.14 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  27.5 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  25.84 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  25.84 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  25.84 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  25.84 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  25.84 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  25.85 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  23.3 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  25.85 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  24.09 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  25.85 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  25.85 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  25.85 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  25.85 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  25.85 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  26.2 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1682  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.52 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  24.37 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  25.36 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  23.76 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.32 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  21.97 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  24.4 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  25.27 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  24.4 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.96 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  26.91 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  24.58 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  24.87 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2780  cobalamin biosynthesis protein  24.15 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0845124  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  22.36 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1143  putative cobalamin biosynthesis protein D  23.28 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  26.74 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.43 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  24.02 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  24.06 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  23.73 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>